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Mikroorganismen spielen bei der Infektion des Wurzelkanalsystems eine unbestreitbare Rolle. Endodontische Infektionen treten auf und schreiten voran, wenn das Wurzelkanalsystem aus dem einen oder anderen Grund der oralen Umgebung ausgesetzt ist und gleichzeitig die körpereigene Immunreaktion nachlässt.Das wesentliche Ziel der endodontischen Therapie besteht darin, im Wurzelkanalsystem ein biologisch geeignetes Milieu zu schaffen, das der Heilung und der Erhaltung der Gesundheit des periradikulären Gewebes förderlich ist. Bakterien sind einer der Hauptfaktoren, die Störungen im Pulpagewebe verursachen, da sie auf verschiedenen Wegen in den endodontischen Raum eindringen, z. B. durch kariöse Läsionen, traumatische Exposition der Pulpa, über den Blutstrom oder durch angrenzende Gewebe. Die an der Pathogenese endodontischer Erkrankungen beteiligten Bakterien reichen von fakultativen Anaerobiern über Aerobier bis hin zu den widerstandsfähigsten Spezies, die in der Lage sind, widrige Bedingungen in der Umgebung zu überleben. Durch Spülung, mechanische Maßnahmen und die antibakteriellen Eigenschaften der Spüllösungen werden die Eradikation der Bakterien und der Erfolg der postendodontischen Behandlung sichergestellt.
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